El programa ls por defecto presenta los nombres de archivos que no comienzan con el caracter '.' y que están en el directorio de trabajo del usuaurio. Los archivos cuyos nombres comienzan con el caracter punto suelen llamarse archivos de configuración, si desea verlos también al usar el comando ls, puede emplear la opción -a (i.e. teclear ls -a). Si desea ver los archivos de un directorio diferente puede dar como argumento el nombre del directorio, por ejemplo ls /usr/bin. Además de -a y -l, el comando ls tiene muchas otras opciones que le permiten especificar que mostrar y como mostrarlo.

A continuación se presentan algunos programas para administrar archivos, junto con una breve descripción y unas pocas opciones ---Puede consultar todas las opciones que recibe un programa con man:

Al usar la opción -a con ls, por lo menos verá dos directorios más: . y .., el primero denota el directorio que examinó y el segundo denota el directorio en el cual está el directorio examinado. Por ejemplo si su directorio de trabajo es /home/pepe el caracter . abrevia /home/pepe mientras que .. abrevia /home.

En la mayoría de programas y en el intérprete de comandos podrá emplear tanto . como .. para referenciar archivos y subdirectorios relativos al directorio de trabajo. Así mismo los archivos y directorios que esten en su directorio de trabajo puede referenciarlo sin prefijo alguno, por ejemplo du . es equivalente a du porque muestra la utilización de disco del directorio de trabajo. Si en su directorio de trabajo tiene un directorio notas que tiene un archivo 2000.txt puede verlo con el comando less notas/2000.txt.

También podrá emplear ~ que abrevia su directorio personal (i.e /home/sulogin). Por ejemplo si desde un intérprete de comandos teclea cd ~, después cd ../.. y después pwd verá que estará ubicado en el directorio raiz.

Otra facilidad que brinda el interprete de comandos es la expansión de nombres de archivos con los comodines * y ?. ? indica una letra mientras que * indica una cantidad cualquiera de letras. Por ejemplo ls /var/lo? lista todos los archivos del directorio var de tres letras que comiencen con lo, mientras que cp *gz ~ copia todos los archivos con sufijo gz en el directorio personal del usuario.

Para brindar algo de privacidad y protección cada archivo o directorio tiene asociados permisos diferentes para el dueño, para el grupo y para los demás usuarios. En el caso de archivos los permisos que pueden darse o quitarse son: (r) lectura, (w) escritura y (x) ejecución. En el caso de directorios los permisos son: (r) para listar los archivos, (w) para escribir, crear o borrar archivos y (x) para acceder a archivos del directorio. ^[15].

Desde un administrador de archivos, puede ver los permisos de un archivo con el botón derecho del mouse cuando el puntero está sobre el archivo, escogiendo la opción apropiada del menú que aparece. Desde un interprete de comandos puede emplear el comando ls con la opción -l. Un ejemplo del resultado de este comando se presenta a continuación:

drwxr-xr-x    5 pepe   users        4096 Feb 21 06:31 graficas
-rw-r-----    1 pepe   users       62561 May 13 18:13 c.tar.gz
lrwxrwxrwx    1 pepe   users          12 Nov 12  2000 a -> /etc/hosts

La primera línea presenta un directorio (la d al principio de la línea lo indica), la segunda presenta un archivo (el guión inicial lo indica) y la tercera un enlace. El nombre del directorio es graficas tiene 5 archivos, fue modificado por última vez el 21 de Febrero del año en curso a las 6:31AM, el dueño es pepe, el grupo es users y el tamaño es 4096 bytes ---en realidad el tamaño cobra sentido sólo en el caso de archivos como c.tar.gz cuyo tamaño es 62561 bytes. Los tres caracteres rwx que siguen a la d inicial indican los permisos para el dueño, los tres siguientes r-x indican los permisos para el grupo y los tres siguientes r-x indican los permisos para el resto de usuarios. Como el orden de estos permisos es siempre el mismo (primero lectura r, después escritura w y después ejecución x), resulta que el archivo x.tar.gz no es ejecutable, que puede ser leido por el dueño y el grupo pero no por los demás usuarios, además puede ser escrito sólo por pepe. Del enlace podemos destacar que se llama a, que enlaza al archivo /usr/bin/awk y que su tamaño y permisos reales los heredará de /usr/bin/awk.

Los permisos de un archivo pueden ser modificados por el dueño o por el administrador del sistema con el comando chmod que espera dos parámetros: cambio por realizar al permiso y nombre del archivo por cambiar. Los permisos se pueden especificar en octal o con una o más letras para identificar al usuario (u para el usuario, g para el grupo, o para los demás usuarios y a para todos), un +, un - o un = y después letras para identificar los permisos (r, w o x). Por ejemplo

El dueño de un archivo pueden ser modificados sólo por el administrador del sistema con el programa chown. Un usuario que pertenezca a varios grupos puede cambiar el grupo de uno de sus archivos a alguno de los grupos a los que perteneza con el program chgrp, por ejemplo

chgrp estudiantes tarea1.txt

Cambiará el grupo del archivo tarea1.txt a estudiantes. Los grupos a los cuales un usuario pertenece son mostrados por el programa groups.